Spolupráce MENDELU s místními a mezinárodními organizacemi působícími v Mongolsku není striktně vázána jen na běžící projekty. S některými organizacemi jsou podepsána také dlouhodobá memoranda o spolupráci nebo porozumění.
Mongolská univerzita přírodních věd
S Mongolskou univerzitou přírodních věd (MULS) probíhá intenzivní spolupráce na vzdělávání a výzkumu již od roku 2019. Během této doby bylo společně realizováno několik projektů, publikováno také několik výstupů a proběhla řada výměn studentů i akademiků. MULS je také součástí konsorcia univerzit.
GIZ
S Německou společností pro mezinárodní spolupráci (Deutsche Gesellschaft für Internationale Zusammenarbeit – GIZ) MENDELU spolupracuje od roku 2021. Po úspěšné spolupráci na projektu STREAM navázala v roce 2024 podpisem memoranda, ve kterém se obě organizace zavazují k pokračování společných aktivit v mongolských lesích a vzájemné podpoře. Tyto aktivity zahrnují vzdělávání, výzkum i přenos českého know-how do mongolské lesnické praxe.
Mongolský fond budoucnosti biologické rozmanitosti
S organizací Mongolský fond budoucnosti biologické rozmanitosti (Mongolian Biodiversity Future Fund) MENDELU začala spolupracovat v roce 2024 v návaznosti na aktivity zaměřené na výzkum biodiverzity.
